Ведущими отраслями промышленности Республики Алтай являются: пищевая промышленность, цветная металлургия, промышленность строительных материалов и деревообрабатывающая промышленность. Их удельный вес в объеме промышленного производства составляет 77,3%.

Пищевая промышленность. Доля отрасли в объеме промышленного производства составляет 35%. В пищевой промышленности действуют предприятия, производящие молочную, мясную, кондитерскую, хлебопекарную, рыбную продукцию. Наиболее крупные предприятия: ОАО «Алтайская продовольственная компания», ООО «Майма-Молоко», ЗАО «Усть-Коксинский маслосырзавод», ЗАО «Чергинский маслосырзавод».

Цветная металлургия. На долю металлургического комплекса приходится 23,3% объема промышленного производства республики. Наиболее крупные предприятия отрасли: ОАО «Рудник «Веселый», ООО «Камнерезы Алтая», ООО «АГМП», ООО «Калгутинское».

Промышленность строительных материалов. Доля отрасли в структуре промышленного производства составляет 10%. Наиболее крупное предприятие отрасли – ОАО «Горно-Алтайский завод железобетонных изделий».