В 2010 г. объём продукции сельского хозяйства составил 2971,9 млн. руб., по сравнению с 2009 г. произошло увеличение на 7,23%. Этому способствовало осуществление комплекса организационно-экономических мер, направленных на создание условий для выхода аграрного сектора из кризиса и улучшения финансового обеспечения отрасли. В структуре продукции сельского хозяйства на долю животноводства приходится 82%, на долю растениеводства – 18%. Примерное соотношение сохранится и на ближайшую перспективу с незначительным увеличением доли животноводства. Животноводство представлено следующими направлениями: овцеводство, козоводство, коневодство, молочное и мясное скотоводство. В личных подсобных хозяйствах развито пчеловодство. Особое значение имеет пантовое оленеводство, дающее уникальную продукцию, не имеющую аналогов по качеству в мире. Наиболее крупные предприятия отрасли: СПК «Абайский», ГУП ОПХ «Теньгинский», ГУП ОПХ «Горно-Алтайский», ГУП «Ширгайта», ООО «Меркит», ГУП «Совхоз «Заречный».