Внутриобластные перевозки грузов осуществляются в основном речным и автомобильным транспортом.
Протяженность внутренних судоходных путей по бассейну р. Оби и ее притокам — около 5 тыс. км.
Протяжённость автомобильных дорог общего пользования с твердым покрытием 4 204 км. Густота путей сообщения составляет 20 км. путей на 1000 км 2 территории. 2 райцентра (Александровское, Белый Яр) и два города (Стрежевой и Кедровый) не соединены с областным центром дорогами с твердым покрытием.
Эксплуатационная длина железнодорожных путей общего пользования составляет 346 км, основная магистраль — Белый Яр—Томск—Тайга.
Доставка пассажиров и грузов (в том числе газет и журналов) во многие населенные пункты производится только воздушным транспортом.
В ноябре—марте для завоза грузов на север области используются «зимники» (зимние дороги).