Сергей Анатольевич Боженов родился 8 апреля 1965 года в станице Чамлыкская Лабинского района Краснодарского края.
После смерти родителей в 1978 году воспитывался в детском доме. В 1980 году приехал в Астрахань и поступил учиться в профессиональное техническое училище № 9 по специальности "моторист-матрос". В 1986 году окончил Астраханское речное училище по специальности "судовождение".
В 1999 году окончил юридический факультет Астраханского государственного педагогического университета.
В 2000 году с отличием окончил Российскую академию государственной службы при президенте РФ по специальности "государственное и муниципальное управление".
В 2002 году с отличием окончил обучение в Саратовском государственном социально-экономическом университете (отделение "Финансы и кредит"). Кандидат политических наук (2007).
С 1986 года по 1992 год работал боцманом на судах загранплавания.
С 1993 года по 1997 год работал на предприятиях в сфере малого бизнеса.
В 1997 году был избран депутатом Астраханского областного законодательного собрания, возглавлял постоянную комиссию по проблемам малого и среднего предпринимательства.
В октябре 2001 года был избран депутатом Думы Астраханской области, был председателем комитета по государственной политике, законности, правопорядку и безопасности.
В 2004 году Сергей Боженов претендовал на пост губернатора Астраханской области, но снял свою кандидатуру.
В декабре 2004 года был избран мэром города Астрахани (40,16% голосов), в октябре 2009 года был переизбран на этот пост (65,56% голосов).
С 2006 года - член партии "Единая Россия".
4 декабря 2011 года избран депутатом Государственной Думы шестого созыва в составе федерального списка кандидатов, выдвинутого Всероссийской политической партией "Единая Россия". Член комитета ГД по федеративному устройству и вопросам местного самоуправления.
17 января 2012 года указом президента РФ Дмитрия Медведева Сергей Боженов был назначен временно исполняющим обязанности главы администрации Волгоградской области.
Сергей Боженов - почетный профессор Астраханского государственного технического университета (2010).
Награжден медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени (2008), орденом Святого Благоверного князя Даниила Московского III степени (2007), орденом Святого Благоверного князя Даниила Московского II степени (2008), Почетной грамотой губернатора Астраханской области (2008), медалью ордена "За заслуги перед Астраханской областью" (2008).
Боженов женат, воспитывает двух дочерей.
