В 1992 году окончил Московский государственный университет им.М.В.Ломоносова. Специальность по образованию - правоведение.
С 1992 по 2002 годы работал специалистом 1 категории, ведущим специалистом, главным специалистом, заместителем начальника отдела Московской регистрационной палаты в г.Москве.
С апреля по июль 2002 года - доцент Российской правовой академии в г.Москве.
В 2002 - 2003 годах - назначен заместителем руководителя Департамента регистрации юридических лиц и учета налогоплательщиков Министерства Российской Федерации по налогам и сборам.
В 2003 - 2004 годах руководитель Департамента государственной регистрации и учета юридических и физических лиц Министерства Российской Федерации по налогам и сборам.
С ноября 2004 по апрель 2006 - начальник Управления государственной регистрации и учета юридических и физических лиц Федеральной налоговой службы.
10 апреля 2006 года приступил к исполнению обязанностей руководителя УФНС России по Воронежской области.
Кандидат юридических наук.
В соответсвии с приказом Министерства финансов Российской Федерации Сергей Сергеевич Дуканов назначен руководителем управления Федеральной налоговой службы по Воронежской области приказом Федеральной налоговой службы от 19 июня 2006 года №САЭ-2б-15/213@.
26 мая 2008 года распоряжением Правительства Российской Федерации № 745-р присвоен классный чин главной группы должностей государственной гражданской службы - Государственный советник Российской Федерации 3 класса.
Приказом Федеральной налоговой службы от 19.05.2009 № ММ-10-4/360@ "О поощрении работников территориальных органов ФНС России:
- За образцовое выполнение служебных обязанностей, многолетнюю безупречную и эффективную государственную гражданскую службу в налоговых органах награжден знаком отличия "Почетный работник ФНС России".