Сергей Иванович Шматко родился 26 сентября 1966 года в Ставрополе.
Служил в Армии — в соединении атомных подводных лодок на Северном флоте.
В 1983–1990 гг. учился на математико-механическом факультете, затем факультете политэкономии Уральского госуниверситета (Свердловск), а в 1990–1992 гг. — на факультете экономики университета г. Марбурга (ФРГ). В 2004 году окончил Высшие академические курсы Военной академии Генштаба ВС РФ по специальности «оборона и обеспечение безопасности Российской Федерации».
С 1992 года работал аудитором в BDO Binder (Франкфурт-на-Майне), директором RFI GmbH — Общества по консультированию по инвестициям в Россию, официального представителя РФФИ в Евросоюзе, научным сотрудником Института проблем инвестирования, возглавлял управление внешних связей Всероссийского банка развития регионов.
1997–1999 — руководитель аналитического центра экономической стратегии «Росэнергоатома».
1999–2001 — советник гендиректора ВНИИАЭС по экономической стратегии.
2002–2005 — председатель Государственного фонда конверсии.
С июня 2005 года — Президент ЗАО «Атомстройэкспорт», с января 2008 года — заместитель директора ОАО «Атомэнергопром» (совмещал две должности).
В мае 2008 года назначен на должность Министра энергетики Российской Федерации.
Кандидат наук.
Женат. Имеет двоих детей.
