В 1980 г. окончил Волгоградский государственный медицинский институт.
Эрдни Шогджиев имеет большой опыт практической и административной работы в здравоохранении: в
В период с 1997 по 2010 годы занимал должность главного врача республиканского противотуберкулезного диспансера. После этого до ноября прошлого года возглавлял Министерство здравоохранения и социального развития РК.
С 6 июня 2011 года приступил к обязанностям главного врача городской поликлиники.
В 2002 году получил государственную награду — знак «Отличник здравоохранения Российской Федерации».
С 2007 года — член партии «Единая Россия».
1 ноября 2011 года Депутаты Элистинского городского Собрания IV созыва выбрали Главой города Элисты — Мэром города Элисты Эрдню Аббяевича.
Женат, имеет одного сына и двух дочерей.