Родился 15 января 1973 года в городе Омске.
Образование - высшее. В 1997 году окончил Тюменскую государственную архитектурно-строительную академию по специальности промышленное и гражданское строительство.
В 1993 году поступил на работу мастером участка в Окружное государственное предприятие «УПТОиК».
С 1995 по 2002 годы трудился в Управлении капитального строительства Ханты-Мансийского автономного округа-Югры. В управлении капитального строительства В.А. Филипенко прошел путь от ведущего специалиста до заместителя начальника отдела контроля.
С 2002 по 2006 год работал первым заместителем директора Департамента строительства Ханты-Мансийского автономного округа -Югры.
В 2006 году избран депутатом, Председателем Думы города Ханты-Мансийска 4 созыва.
В 2011 году избран депутатом по второму избирательному округу, затем, Главой города Ханты-Мансийска - исполняющим полномочия Председателя Думы города Ханты-Мансийска.
Член партии «Единая Россия».
Женат, воспитывает двух сыновей и дочь.